軟件著作權登記的作用一：作為稅收減免的重要依據

財政部、國家稅務總局《關于貫徹落實〈中共中央、國務院關于加強技術創新，發展高科技，實現產業化的決定〉有關稅收問題的通知》規定："對經過國家版權局注冊登記，在銷售時一并轉讓著作權、所有權的計算機軟件征收營業稅，不征收增值稅。"

軟件著作權登記的作用二：作為法律重點保護的依據

《國務院關于印發鼓勵軟件產業和集成電路產業發展若干政策的通知》第三十二條規定："國務院著作權行政管理部門要規范和加強軟件著作權登記制度，鼓勵軟件著作權登記，并依據國家法律對已經登記的軟件予以重點保護。"比如：軟件版權受到侵權時，對于軟件著作權登記證書司法機關可不必經過審查，直接作為有力證據使用；此外也是國家著作權管理機關懲處侵犯軟件版權行為的執法依據。

軟件著作權登記的作用三：作為技術出資入股

《關于以高新技術成果出資入股若干問題的規定》規定："計算機軟件可以作為高新技術出資入股，而且作價的比例可以突破公司法20%的限制達到35%"。甚至有的地方政府規定："可以100%的軟件技術作為出資入股"，但是都要求首先必須取得軟件著作權登記。

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