與第三方跨境電商平臺不同的是，獨立站賣家沒有平臺來幫助自己協助繳稅。獨立站作為一個自主平臺，不僅在出售上擁有著極高的自由度，在繳稅問題上也需要親力親為。那么，跨境電商獨立站應當如何繳稅呢？

以在歐盟地域建站的賣家為例，如果賣家的公司注冊地址在非歐盟 ，那么賣家就需要指定一名歐盟任一 的稅務代表，在稅代所在國注冊。如果賣家的公司注冊地址在歐盟本地的話，就需要賣家在公司所在國注冊IOSS，不能夠在其他 注冊。

IOSS是以公司為注冊原則的，因此只要是一個公司主體的自建站就可以應用同一個IOSS號碼，相反則需要進行多個IOSS號碼的注冊能力夠正常繳稅。

IOSS的出售情形會根據目標國跟增值稅稅率來進行細分。稅代需要按月向注冊國的稅局進行相應的稅務申報，在申報后的次月底睡袋就會提交相應的IOSS增值稅申請表來幫助賣家申報歐盟內所有低價值商品的出售情形。同時，賣家需要在稅務申報后的次月月底向成員國支付IOSS增值稅申報表中的增值稅總額。

如果賣家在其他地域樹立自建站，與歐盟不同的是，賣家只需要在站點所在國進行相應的稅務申報即可。當下，歐盟 對跨境電商獨立站賣家并沒有采用較為強硬的辦法。但獨立站賣家群體的稅務合規化是后續獨立站發展的大趨勢。獨立站賣家需要不斷地了解政策來應對后續可能涌現的稅務政策變動。

跨境電商獨立站的運營繳稅包括了關稅，增值稅等諸多內容，不同的 其稅收政策以及稅率也有所分別。賣家在建站前就需要了解建站當地的稅率情形，如果稅率過高賣家可以思考在其他站點建站。乃至賣家在后續獨立站出售產品的定價流程中，也需要將稅率等內容思考其中。否則很容易造成無法收回成本的情形。

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